Warszawa: Wybór grupy badawczej WGRB 02 10
Numer ogłoszenia: 34514 - 2010; data zamieszczenia: 08.02.2010
OGŁOSZENIE O ZAMIARZE ZAWARCIA UMOWY - Usługi

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY

I. 1) NAZWA I ADRES: Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk, ul. Pawińskiego 5a, 02-106 Warszawa, woj. mazowieckie, tel. 022 6584724, faks 022 6584636 , strona internetowa www.ibb.waw.pl

I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO: Inny: Instytut Polskiej Akademii Nauk.

SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego: Wybór grupy badawczej WGRB 02 10.

II.2) Rodzaj zamówienia: Usługi.

II.3) Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia: Wybór grupy badawczej, która podejmie się wykonać badania naukowe opisane w ramach dwu zadań - Zadania 7, podzadania 7.2 i 7.3 oraz Zadania 8, podzadania 8.2, 8.3, 8.4, wynikających z realizacji umowy zawartej w dniu 15 września 2009 roku pomiędzy IBB PAN a Ośrodkiem Przetwarzania Informacji o dofinansowanie projektu numer UDA-POIG.01.03.01-14-036/09-00 pod tytułem Zastosowanie pochodnych poliizoprenoidów jako nośników leków i regulatorów metabolizmu realizowanego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, lata 2007-2013, Priorytet 1. Badania i Rozwój Nowoczesnych Technologii, Działanie 1.3 Wsparcie Projektów B+R na rzecz przedsiębiorców realizowanych przez jednostki naukowe, Poddziałanie 1.3.1 Projekty rozwojowe. Badania będą polegały na: Zadanie 7. Badanie właściwości epoksy-Prenoli podwyższających poziom biosyntezy ubichinonu i obniżających biosyntezę cholesterolu 7.2. Badanie wpływu epoksy-Prenoli i ich pochodnych na metabolizm ubichinonu i cholesterolu w komórkach ssaków; Epoksydowane pochodne poliizoprenoidów i ich hydrolizowane pochodne, a także znakowany trytem mewalonian przygotowane będą we współpracy z IBB PAN. Preparaty epoksydowanych poliizoprenoidów i ich hydrolizowanych pochodnych będą dodawane do mediów hodowlanych linii komórkowych równocześnie z trytowanym mewalonianem. Analogicznie, substraty te podawane zwierzętom hodowlanym (myszy lub szczury). Warunki doświadczenia będą optymalizowane. Z zebranego materiału biologicznego (komórki z hodowli, organy zwierząt - głównie wątroba, nerki, serce) wyizolowane i oznaczone ilościowo zostaną interesujące nas lipidy, cholesterol, ubichinon, dolichol, estry cholesterylu, , estry dolichylu, oraz pochodzące z diety tokoferole (HPLC/UV). Powstawanie znakowanych izotopowo lipidów (t.j. cholosterolu, ubichinonu i dolicholu) także będzie mierzone (HPLC/UV/przepływowy detektor radioaktywności). Przeprowadzone będą badania zawartości i poziomu znakowania lipidów w organellach komórkowych (np. mitochondria, retikulum endoplazmatyczne) wybranych organów(wątroba, nerki). Dla ubichinonu i ew. tokoferolu analiza uzupełniona będzie o ocenę ilości zredukowanego ubichinonu i tokoferolu - ten pomiar wykonany będzie techniką HPLC z zastosowaniem detektora elektrochemicznego (HPLC/ED). 7.3. Badanie wpływu epoksydów na okres półtrwania ubichinonu Dla wybranych epoksydów badany będzie także ich efekt na okres półtrwania UQ. Radioaktywnego prekursora ([3H]mewalonianu) podawany będzie zwierzętom przez określony okres, a następnie mierzony będzie zanik radioaktywności [3H]UQ. Takie badania wymagają wykorzystania dużej liczby zwierząt (po 3-4 na każdy punkt czasowy, przewiduje się ok. 10 punktów czasowych). Metodyka badań wymaga zastosowania aparatu HPLC/UV sprzężonego z przepływowym detektorem radioaktywności do pomiaru radioaktywności radioaktywnego UQ. Efekty merytoryczne Zadania 7 uzyskane w przez grupę badawczą: 2 lata realizacji projektu ocena wpływu wybranych epoksy-Prenoli i ich pochodnych na metabolizm ubichinonu i cholesterolu w modelowych liniach komórkowych (HepG2) 2,5 roku realizacji projektu ocena wpływu wybranych epoksy-Prenoli na metabolizm ubichinonu i cholesterolu in vivo (myszy) 3 lata realizacji projektu zbadanie wpływu epoksydów na okres półtrwania ubichinonu 4 lata realizacji projektu przygotowanie zgłoszeń patentowych Zadanie 8. Badania metabolizmu i toksyczności amino-Prenoli oraz epoksy-Prenoli. 8.2. Podawanie amino-[3H]Prenoli lub epoksy-[3H]Prenoli do hodowli komórkowych i zwierzętom hodowlanym Znakowane trytem amino-[3H]Prenole przygotowane będą we współpracy z IBB PAN i IChO PAN. Znakowane trytem epoksy-[3H]Prenole przygotowane będą we współpracy z IBB PAN. Zsyntetyzowane amino-[3H]Prenole lub epoksy-[3H]Pren podawane będą do medium hodowlanego, w którym hodowane będą komórki ssacze. Pochodne [3H]Prenoli będą podawane w roztworze etanolowym lub roztworze dwumetylosulfotlenku (DMSO). Na początkowym etapie badań wykorzystana zostanie linia HepG2. Hodowle prowadzone będą dla różnych stężeń trytowanego prekursora i w różnych czasach inkubacji, aby zaobserwować możliwe szerokie spektrum produktów. Równolegle, amino-[3H]Prenole lub epoksy-[3H]Prenole podawane będą myszom. Testowane będą różne drogi podawania (np. injekcje dootrzewnowe). Zwierzęta będą uśmiercone po 6, 12 i 24h od czasu podania badanego preparatu, a wybrane organy (wątroba, nerki, mózg, ew. inne) zostaną poddane dalszej analizie. W innej serii doświadczeń badane substancje dozowane będą przez kapsułkę (pompę Alzac) umieszczoną pod skórą myszy. Zwierzęta umieszczone zostaną w klatkach metabolicznych, mocz i kał zbierane będą do analizy radioizotopowo znakowanych metabolitów. Zwierzęta będą uśmiercone po 5 dniach i ich organy zostaną pobrane i analizowane pod kątem zawartości radioizotopowo znakowanych metabolitów. 8.3. Izolacja i analiza strukturalna znakowanych trytem metabolitów powstających z amino-[3H]Prenoli lub epoksy-[3H]Prenoli Przeprowadzona będzie ekstrakcja produktów metabolizmu amino-[3H]Prenoli i epoksy-[3H]Prenoli. Zebrane tkanki, podobnie mocz i kał, będą ekstrahowane mieszaniną chloroformu i metanol w odpowiednich proporcjach. Uzyskane ekstrakty będą analizowane pod kątem obecności znakowanych trytem związków (produktów mniej i bardziej polarnych). Do analizy wstępnej wykorzystane będą metody chromatograficzne (TLC, CC, HPLC) w połączeniu z pomiarem radioaktywności. Wstępnie scharakteryzowane metabolity przekazane zostaną do dalszych badań strukturalnych do IBB i IChO w Warszawie. 8.4. Podawanie nieznakowanych amino-Prenoli lub epoksy-Prenoli i ich pochodnych do komórek i zwierzętom hodowlanym, badania toksyczności, izolacja produktów metabolizmu i analiza strukturalna Wybrany amino-Prenol lub epoksy-Prenol lub jego pochodna hydrolizowana podawany będzie w zróżnicowanych dawkach (w zakresie niskich i wysokich stężeń) do komórek HepG2 przez dłuższy czas, aby ocenić przeżywalność komórek. Równolegle, zwierzętom hodowlanym przebywającym w klatkach metabolicznych podawane będą badane substancje przez okres 2 tygodni. Prowadzone będą obserwacje fizjologiczne, zbierany będzie mocz i kał. Zebrane próbki (organy zwierzęce, mocz i kał)ekstrahowane będą mieszanina chloroform-metanol. Wyizolowane metabolity analizowane będą jak opisano wyżej. 8.5 Badnia wpływu amino-prenoli, epoksy-prenoli i ich pochodnych na indukcję ekspresji genów - analiza transkryptomiczna Badany będzie wpływ badanych związków na profil mRNA wybranych genów. Z części materiału biologicznego uzyskanego z powyższych doświadczeń wyizolowane będzie totalne RNA. Równoległe próbki przygotowane będą z komórek i tkanek kontrolnych, tzn. nie poddanych działaniu testowanych związków. Próbki analizowane będą metodą Real-time PCR. Równolegle, analiza zmian ekspresji genów w badanych próbkach zostanie wykonana przy użyciu mikromacierzy (Affymetrix) w IBB PAN. Efekty merytoryczne Zadania 8 uzyskane w przez grupę badawczą: 1 rok realizacji projektu izolacja produktów metabolizmu epoksy-[3H]Prenoli powstających w komórkach HepG2 1,5 roku realizacji projektu analiza strukturalna produktów metabolizmu epoksy-[3H]Prenoli 2,5 roku realizacji projektu izolacja produktów metabolizmu amino-[3H]Prenoli powstających w komórkach HepG2 3 lata realizacji projektu analiza strukturalna produktów metabolizmu amino--[3H]Prenoli wstępna identyfikacja genów indukowanych lub hamowanych przez epoksy-Prenole i amino-Prenole 3,5 roku realizacji projektu analiza strukturalna produktów metabolizmu epoksy-prenoli 4 lata realizacji projektu przygotowanie zgłoszeń patentowych.

II.4) Wspólny Słownik Zamówień (CPV): 73.11.10.00 - Laboratoryjne usługi badawcze 73.10.00.00 - Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe 73.11.00.00 - Usługi badawcze .

II.5) Szacunkowa wartość zamówienia (bez VAT): jest równa lub przekraczająca kwoty określone w przepisach wydanych na podstawie art. 11 ust. 8 ustawy.

SEKCJA III: PROCEDURA

Tryb udzielenia zamówienia: Zamówienie z wolnej ręki

• 1. Podstawa prawna

  Postępowanie wszczęte zostało na podstawie art. 67 ust. 1 pkt 1a ustawy z dnia 29 stycznia 2004 r. - Prawo zamówień publicznych.

• 2. Uzasadnienie wyboru trybu

  Aby mieć pewność, że grupa badawcza będzie w stanie wykonać opisane wyżej badania, tzn. dysponuje wiedzą i doświadczeniem, a także odpowiednim potencjałem technicznym oraz osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, musi ona spełniać poniższe warunki: 1. dysponować laboratorium badawczym wyposażonym w następujący sprzęt: - wyposażenie do prowadzenia hodowli komórek ssaków (inkubatory); - dostęp do zwierzętarni oraz zezwolenie komisji etycznej na prowadzenie doświadczeń na myszach planowanych w projekcie; - aparat HPLC z detektorami UV i przepływowym detektorem radioaktywności; - aparat HPLC z detektorem elektrochemicznym; - termocykler do analiz Real-time PCR; - spektrofluorymetr - typowy sprzęt do homogenizacji, ekstrakcji i przygotowania próbek do analiz jakościowych i ilościowych lipidów; 2. skład grupy - przynajmniej 3 pracowników naukowych (minimum stopień naukowy doktora) z ustaloną pozycją zawodową (min. 10 lat pracy), dysponujących doświadczeniem zawodowym w dziedzinie badań nad biosyntezą i funkcją biologiczną ubichinonu i innych lipidów w komórkach ssaków; 3. dorobek publikacyjny - minimum 10 prac naukowych dotyczących badań nad biosyntezą i metabolizmem ubichinonu u ssaków opublikowanych przez członków zespołu w okresie ostatnich 5 lat w recenzowanych czasopismach naukowych. Według najlepszej wiedzy Zamawiającego, jedyną taką grupą badawczą, spełniającą te wszystkie warunki, jest grupa badawcza Uniwersytetu w Sztokholmie, kierowana przez prof. Gustawa Dallnera, zlokalizowana w instytucji, której oficjalna nazwa brzmi: Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Arrhenius Laboratories for Natural Sciences, prof. Gustav Dallner Arrhenius vagen 16, 106 91 Stockholm Sweden. Wobec powyższego, tej Grupie, Instytut zamierza powierzyć realizację zamówienia, stosownie do art. 67 ust. 1 pkt 1) a) ustawy z dnia 29 stycznia 2004 roku - Prawo zamówień publicznych (t. j. Dz. U. z 2007 roku, Nr 223, poz. 1655 ze zm.).

SEKCJA IV: UDZIELENIE ZAMÓWIENIA

NAZWA I ADRES WYKONAWCY KTÓREMU ZAMAWIAJĄCY ZAMIERZA UDZIELIĆ ZAMÓWIENIA

• Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Arrhenius Laboratories for Natural Sciences, prof. Gustav Dallner, Arrhenius vagen 16, Sztokholm, kraj/woj. Szwecja.